財政部頒訂之執行業務者費用標準，有關醫療院所全民健康保險收入（下稱健保收入），自95年度起，改以醫療院所每年經行政院衛生署中央健康保險局（下稱健保局）核定之服務點數，按每點0.78元計算其成本費用；因健保局追扣或補付醫療款與核定點數無涉，純屬總額點值結算後與原核算點值之差異所造成，故該追扣或補付收入如屬95年度以後（含95年度）部分，無須再減除必要費用。

【舉例說明】
納稅義務人A君執業之診所98年度未依法辦理結算申報，經國稅局依查得資料核定執行業務收入1,854,261元，並依財政部頒訂之執行業務者費用標準計算其必要費用，核定執行業務所得394,566元。A君復查主張健保局98年度補付97年度之收入105,511元，已包含於98年度扣繳憑單給付總額內，應以該補付金額依年度平均點值換算之點數計算必要費用云云。經國稅局以，財政部頒訂之執行業務者費用標準，自95年度起，健保收入係以健保局核定之服務點數為計算成本費用之基礎，而該97年度補付金額僅係97年度第2季至第4季總額點值結算後之補付金額，97年度核定點數並無變動，故無須再減除必要費用，A君主張並無理由，乃予復查駁回。

提醒納稅義務人，基於「程序不合，實體不究」原則，對行政處分不服提起訴願，須在法定期間內為之，如逾訴願期間，將遭受理訴願機關為訴願不受理之決定，影響自身權益甚鉅。