Ｂ型肝炎病毒在複製的過程中，會釋放一段蛋白，這段蛋白就是ｅ抗原。如果抽血檢查發現ｅ抗原、亦即陽性反應，則表示病毒正複製、繁殖。

ｅ抗原陽性者，病毒複製能力、傳染力皆高，先前研究顯示，這類患者如果完全不接受治療，罹患肝癌的機率是健康人的數十倍，一定要積極接受評估治療，且盡量在四十歲以前讓ｅ抗原消失。

至於ｅ抗原陰性者，其體內的病毒傳染力與複製力皆低，但過去研究顯示，這類患者罹癌機率仍是健康人的數倍。長庚這項追蹤研究顯示，若ｅ抗原陰性患者，肝指數持續保持正常，則肝癌與肝硬化的機會可降更低。

雖然坊間有保肝藥等聲稱可以讓肝指數正常，但醫師並不建議使用，建議仍以保持規律生活、健康作息、不熬夜、不抽菸、不喝酒為佳。

值得注意的是，成大附設醫院內科教授張定宗指出，ｅ抗原陰性患者一旦曾經肝發炎、纖維化、病毒嵌入細胞ＤＮＡ等，或病毒量很高，則即使後來肝功能正常，病變風險仍比健康人高。