每年到了這個節日（農曆八月十五日），雅美族人就不食用天上飛下來的飛魚了，家裡吃不完的飛魚乾掛在屋旁的柴架上，任由豬或狗等吃食，並不隨意丟棄，表示對飛魚的尊重。
飛魚季時雅美族人所捕撈的飛魚，大部分都製成了飛魚乾，以方便儲存。在高溫多雨又潮溼的蘭嶼島上，食物很容易發霉腐敗。所以，雅美人把飛魚乾放在灶上的置物架上儲存，用炊飯時產生的熱氣，保持飛魚乾的乾燥，延長其食用期限。但到了飛魚終食祭時，儲存的飛魚乾數量已非常少，且飛魚乾在儲存三個月後，保存期限也到了，不能在繼續食用了。
在食用最後的飛魚乾前，雅美族人都會先說祝福的話，祝福自己和家人能擁有健康的身體，和黃金般閃亮且光滑的肌膚。現今的雅美人，因有冰箱或冷凍櫃等先進的儲存設備，可以將飛魚乾儲存得更久，終食祭後仍繼續食用飛魚乾，不再尊重節日的意義，是相當可惜的。