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《黃帝內經》是現存最早中醫理論著作，對後世中醫學理論的奠定有深遠的影響。相傳是黃帝與岐伯、雷公、伯高、俞跗、少師、鬼臾區、少俞等多位大臣討論醫學的記述，但傳統上多認為此書成書於戰國時期，但也有學者認為成書應在西漢中。

西漢漢成帝時，劉向等人曾大規模校理古籍，李柱國則負責校理方伎，原書目先載於劉向《別錄》，後載於其子劉歆《七略》，今二書已佚，但其目錄內容被東漢班固引錄於《漢書》〈藝文志〉中，後世仍可以推見其原貌。《漢書·藝文志·方技略》載有醫經、經方、神仙和房中四種中醫典籍。其中醫經有：

·                   《黃帝內經》十八卷，《外經》三十七卷；

·                   《扁鵲內經》九卷，《外經》十二卷；

·                   《白氏內經》三十八卷，《外經》三十六卷，《旁篇》二十五卷。

這是歷史上對《黃帝內經》最早的記錄，學者認為《黃帝內經》的編著及命名很可能是成自劉向之手。

在南北朝的時候，《黃帝內經》已經因傳抄及戰亂而散失，分成《素問》及《針經》兩種版本，分別流傳。最早對內經進行整理的學者，是晉朝的皇甫謐，他根據《素問》、《針經》及《明堂孔穴》，編著成《黃帝三部鍼灸甲乙經》一書。在《甲乙經》序中，他說：「按《七略》、《藝文志》，《黃帝內經》十八卷，今有《針經》九卷，《素問》九卷，二九十八卷，即內經也，亦有所亡失。」

南北朝時出現了第一本為《素問》作校註的書，作者為全元起。全元起校注的《素問》本，北宋時尚存，以後便散失不見了。今從林億等所校訂的《重廣補註黃帝內經素問》中，尚可看到全元起編排的卷目次第和少量注文。

唐初楊上善將《靈樞》、《素問》的條文，根據內容重新分類，編次成《黃帝內經太素》三十卷。此書雖然早於王冰，但流傳不廣，對於後世的影響較小，在宋朝時已經失傳。

《隋書·經籍志》中記載有黃帝素問九卷，梁八卷；黃帝鍼經九卷。這個版本應該就是全元起及楊上善所採用的底本，其中有許多重複及錯誤難解的地方，因此並沒有吸引很多醫家對它進行深入研究，在王冰本出現之後，就被取代了。

對後世影響最大的內經版本，首推唐代王冰註釋的《黃帝內經素問》。王冰深入研究《素問》，對當時通行的版本提出批評^[1]並決心進行整理，耗時十二年，在唐朝寶應年間完成出版。王冰以其師的「張公秘本」作為藍本，補入原本失傳的七卷，並參校其它流傳版本的《素問》加以整理、註釋、編排次序，完成二十四卷的巨著。王冰將原來的內容用黑筆來寫，他加上的註釋用紅筆來寫，以區分原文與註釋之別。但在後來百年的傳抄之下，紅字又被寫成黑色，何處為王冰註釋，又難以區分了。王冰補入第七卷的七篇大論－《天元紀大論》、《五運行大論》、《五常政大論》、《六微旨大論》、《六元正紀大論》、《氣交變大論》、《至真要大論》是運氣學說的主要依據。

王冰版的素問，後經北宋林億等重新校著後，稱為《重廣補注黃帝內經素問》（又稱《新校正》本），成為最完整的《素問》善本，也是官方考試的依據。現今流傳的《黃帝內經》就是這個版本，金元明清的醫家，註解內經時，也都採用這個版本。

內經「刺法論篇第七十二」和「本病論篇第七十三」兩篇，在王冰註釋時已經失傳。北宋林億校正《素問》時，曾提及當時有《素問亡篇》的流傳，劉溫舒《素問入式運氣論奧》中附有此兩篇原文，署為《素問遺篇》。後世大多認為出自唐宋間人偽托。

《黃帝內經》共十八卷，《素問》、《靈樞》各有九卷、八十一篇。內容包括攝生、陰陽、臟象、經絡和論治之道。其成書年代一向有爭議，大約是戰國至秦漢的作品。成書時間一般有世界記憶計畫與三種流傳說法：

·                   一、《黃帝內經》是「三墳之書」其中之一，認為是黃帝所寫，但黃帝年代各方面不夠成熟，可信度較低；

·                   二、認為它是春秋戰國時候的著作，北宋程顥^[2]、司馬光都持這種立場。

·                               因一百六十二篇文章裡，從文字、語言、用詞、以及所涉及到的社會背景等角度，都不乏春秋戰國的背景。因春秋戰國長達數百年之久，確實可能包含多種觀點、不同習慣的內容。

·                   三、認為《黃帝內經》非一時一人之作，成書時間約在西漢。

·                               《黃帝內經》最早見於《漢書·藝文志》，《漢書·藝文志》作者班固是根據《七略》刪其要而成；而《七略》是劉向、劉歆父子，作為圖書分類目類來主持的，分工校正方技類，而由李柱國來分工、校正醫書，時間是西漢成帝河平三年，也就是公元前26年，而被認為《黃帝內經》最晚也要在公元前26年成書。最早是在司馬遷寫《史記》的時候，史記中記載不少當代醫學，如公乘陽慶、倉公、扁鵲等，但唯獨沒有記載更為重要的《黃帝內經》，所以被認為不可能早於寫《史記》的時代，司馬遷是在公元前99年入獄時撰寫了史記，從上述推論《黃帝內經》大約是在公元前99年至公元前26年。

·                               還有其它的旁證是，1973年，在馬王堆3號墓所出土的簡帛醫書有《足臂十一脈灸經》、《陰陽十一脈灸經》、《五十二病方》、《脈法》、《導引圖》等14件醫書，而墓主是西漢初年封於長沙的軑侯利倉之子，下葬時間為漢文帝十二年，即公元前168年，這些文獻較為簡略粗糙，例如只有十一經脈，而黃帝內經是十二經脈，從理論的簡繁、完善程度上認為，十一經脈要早於十二經脈，也就是完備的《黃帝內經》的成書年代要晚於公元前168年。

《黃帝內經》各篇文章的時間差距，從文字、反映的社會背景、語言特點、音韻學特點來考據，前後時間可能相差幾百年之久。

黃帝內經整理先人積累的豐富的醫療經驗，升華為理性認識，形成系統的醫學理論，並且進一步駕御醫療實踐，建立了中醫學臨床規範，成為中國傳統科學中探討生命規律及其醫學應用的系統學問。

2010年中國向「世界記憶亞太地區名錄評審委員會」提案據認公元1339年木板印刷，由胡氏古林書堂印刷出版，為當今世界上保存最早、最完好的版本。出於戰國時代的《黃帝內經》。「世界記憶亞太地區名錄評審委員會」通過將這部文獻列入《世界記憶亞太地區名錄》。

它為中醫學理論體系的建立打好了結構框架，奠定了中醫學發展的基礎，所以中醫亦稱為「岐黃之術」。《黃帝內經》提到：「聖人不治已病，治未病；不治已亂，治未亂。」這已經是預防醫學的理想。

黃帝內經影響了其後的中醫經典。如，東漢張仲景的《傷寒雜病論》、唐朝孫思邈的《千金要方》等。

1.    南北朝, 全元起, 《素問訓解》

2.    唐朝, 楊上善, 《黃帝內經太素》

3.    唐朝, 王冰, 次注《黃帝內經素問》

4.    北宋, 高保衡/林億, 《重廣補注黃帝內經素問》

5.    日本, 丹波元簡, 《素問識》《靈樞識》

1.     ^ 《黃帝內經素問》王冰註序云：「而世本紕繆，篇目重疊，前後不倫，文義懸隔，施行不易，披會亦難，歲月既淹，襲以成弊。或一篇重出而別立二名；或兩論并吞而都為一目；或問答未己，別樹篇題；或脫簡不書，而雲世闕。重經合而冠針服，並〈方宜〉而為〈咳篇〉，隔〈虛實〉而為〈逆從〉，合（經絡）而為〈論要〉，節〈皮部〉為〈經絡〉，退〈至教〉以先針。諸如此流，不可勝數。」

2.     ^ 《二程全書》程灝曰：「觀素問，文字氣象，只是戰國時人作，謂之三墳書則非也。道理總是，想當時亦須有來歷。」

·                   丹波元胤《中國醫籍考》

·                   王冰注《素問》之研究

·                   廖育群：《重構秦漢醫學圖像》（上海：上海交通大學出版社，2012）。