公司組織之營利事業，會計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經該管稽徵機關核定之前10年內各期虧損，自本年度純益額中扣除後，再行核課。
依據財政部函釋，公司組織之營利事業適用所得稅法第39條規定，自本年度純益額中扣除前10年各期核定虧損者，應將各該期依同法第42條規定免計入所得額之投資收益，先行抵減各該期之核定虧損後，再以虧損之餘額，自本年度純益額中扣除。
 
【舉例說明】
某公司組織之營利事業99年度獲配不計入所得額課稅之股利淨額100萬元，該年度經稽徵機關核定虧損為120萬元，則依所得稅法第39條規定，自100年度純益額中扣除99年度核定虧損時，應將上述不計入所得額課稅之股利淨額100萬元，自該年度核定虧損120萬元中抵減後，再以其虧損之餘額20萬元，自100年度純益額中扣除。
 
公司適用盈虧互抵規定，應將虧損年度不計入所得額課稅之股利淨額先行抵減核定虧損後，再以餘額自本年度純益額中扣除，以免遭稽徵機關調整補稅及加計利息。