「人間亦有揚州鶴，但泛如來功德船。」

　　這是清初玉琳國師＜題藥師日課語＞最末一句。僅十四字，而明白點出藥師法門殊勝之處。古來祖師大德，亦多推許藥師法門的功德力。若能依照《藥師琉璃光如來本願功德經》中所述，如實修行，當入此圓滿尊特法門。

　　在一般的觀念中，對於藥師法門功德力的認知，往往只停留在消災、除病、延壽，或者求財增益等等狹隘的世俗利益上。這是對於藥師法門的了解不夠深入所致。事實上，藥師法應該視為獨部大法。在大藏經中，顯教的部分，藥師經現有四種譯本，祖師大德亦作《慈悲藥師寶懺》及《藥師三昧行法》等法門流傳後世；而密教部中，並有十部藥師法門儀軌。除此之外，藥師法亦是其他法門的輔助法，如孔雀明王法中，即有藥師灌頂真言。由此觀之，若能依教修持藥師法，自有無比殊勝覺受及感應。正如經中所言，諸有願求，悉令滿足，乃至無上菩提，無不成就，實是難可思議。

　　如《藥師三昧行法》＜釋疑第四＞所說：「此經。舊謂致福消菑（災）之要法。是豈盡然哉。予謂是。乃明心作佛之秘典也。何以明之。十二大願。彰因行之弘遠。七寶莊嚴。顯果德之純淨。行願功德也。憶念稱名。則眾苦脫。祈請供養。則諸願成。慈悲方便也。而是中一一稱性施為。其所施為處。即甚深處也。苟能了之。思過半矣。若病人求救。應死更生。王者禳菑。轉禍為福。與夫消百恠（怪）。除九橫等。是乃所謂致福消菑之法。藥師于此。特垂方便中方便。急先其標耳。故知是經。正淨佛國土。成就眾生。開摩訶衍門。羅盡大心眾生。作一番出世要事。則謂成佛秘典。豈不信哉。」

　　又如清代淨挺禪師，著有＜藥師燈燄＞一文，開闡藥師法門亦十分透徹。如文章第一段：「問。既大乘經。何故說有為法。答。舉足下步無非道場。一色一香誠哉佛事。治世語言、資生產業皆與實相不相違背。方便善巧何不可耶。」又如後文「以有所得心修無所得法，還以有所得法證無所得心。」、「實際理地不受一塵，佛事門中不捨一法。」等句子，於藥師法心有疑惑的行者，當可於此得到解釋。

　　其次，藥師琉璃光如來聖像，在許多寺院常與本師釋迦牟尼佛、阿彌陀佛並列為三寶佛。這一供奉法則，太虛大師《藥師本願經講記》中的解釋為：「中國諸大叢林之大雄寶殿中，皆供三佛，中供釋迦，其左右兼供藥師與彌陀者，正顯釋迦在此界為主中主，藥師彌陀為主中賓。主中主者，乃如如不動之無為妙體，雖無為而無不為，一切諸法莫不依止此，一切作為咸皆歸向此，故能達生死本空而究竟解脫者，即為主中主，而更不須他求。然對世界眾生之未了生死者，從如如不二之妙體中，開出藥師與彌陀之兩大法門。將濟生之事，付與東方之藥師；度死之事，付與西方之彌陀。蓋東方位四方之首，居四季之春，生長萬物，故資生延壽之事屬之；西方位四方之三，居四季之秋，萬象蕭條，故救死度亡事屬之。是知藥師彌陀，乃從此界釋尊全體所起之大用，雖有消災度亡之別，攝用歸體，咸不外乎無為而無所不為之釋迦佛；而體用別論，亦不妨列有三佛也。」

　　此處所持誦《藥師琉璃光如來本願功德經》之經本，為現今流通本。依照弘一大師＜藥師如來法門略錄＞一文所說：「藥師琉璃光如來本願功德經一卷，唐玄奘譯。此即現今流通本所據之譯本。現今流通本與原譯本稍有不同者有增文兩段，一為依東晉譯本補入之八大菩薩名，二為依唐義淨譯本補入神咒及前後文二十餘行。」

　　而本經各譯本，太虛大師於《藥師本願經講記》中敘述如下：

「今略明五譯之概史於下：

 甲、晉帛尸梨密多羅譯  在六朝之初，東晉之時，有西域三藏名帛尸梨密多羅者，此云『吉友』（善友之義），初翻此經，名佛說灌頂拔除過罪生死得度經。但無獨立本，乃附於佛說灌頂大神咒經中。此經古有十二卷，今在清藏合訂六卷，而屬於最後一卷。此帛尸梨密多羅三藏，為中國密宗經典初翻之人。普通謂密典至唐善無畏、金剛智、不空等時始有，其實唐前已有；如大灌頂神咒經、大孔雀王經等，皆屬密部。又謂唐前為雜密，言其未成系統，但此為唐人言論；其實、東晉吉友等翻大灌頂等經，亦為中國密典之叢書；而此師為中國唐前之極重密宗者，亦見其所從來之西域，其時密部已極流行，故翻譯時，將此藥師經，亦攝入大灌頂神咒經之最後品。故此大灌頂經，亦猶大寶積經之糅集多經而成，在此師譯附於大灌頂經觀之，固視為密宗之經典也。 

乙、宋慧簡譯  此在東晉後，南北朝之劉宋孝武帝時代，有慧簡法師，在鹿野寺再翻此經。名藥師琉璃光經。今藏經中已佚此本，但古大藏目錄中，尚載其名。又在達磨笈多第三譯之序文上，亦敘述其事，故信有此譯也。 

丙、隋達磨笈多譯  在六朝之末，隋文帝大業十一年時，達磨笈多復翻此經。達磨譯法，笈多譯行，即法行三藏所譯。法行為主譯，尚有餘人為助譯，故其經上表法行等譯。名佛說藥師如來本願經。序因慧簡之譯，於梵文、華文未善，故作第三譯云。 

丁、唐玄奘譯  今本題唐三藏法師玄奘奉詔譯，即此第四譯是。玄奘三藏於唐太宗貞觀初年間，因感經典義理殘舛，發願入印求法，所謂策杖西遊，周歷諸國。居印度十七年，遍學大小乘教典。至貞觀二十年外，重回中原，從事譯經。在中國譯經史上，翻譯最多，亦最正確。今此藥師琉璃光如來本願功德經，即其所譯。玄奘其名，三藏法師乃所稱之德號；以其能通徹經律論三藏之法，依此為師，且能將三藏法廣為宣揚為人天之師，故名三藏法師。其譯經歷唐太宗、唐高宗兩朝。奉詔譯者，即奉太宗或高宗之詔，建立譯場。其翻譯時，有度語者，筆受者，證義者，潤文者多人，而以唐三藏為主，故標以斯名耳。 

戊、唐義淨譯  自唐太宗後，經過唐高宗，至武則天朝，約在玄奘三藏後二三十年間，有義淨法師者，踵法顯之芳躅，慕玄奘之高風，遍遊印度，歸而復譯此經，名曰藥師琉璃光七佛本願功德經。然玄奘既譯此經，義淨何須再譯？其所以重譯者，藥師佛雖與奘譯相同。而餘六佛，則為奘譯所無，故須重譯。其譯本今在藏中，上下兩卷，七佛本事，備述其中。 

總觀其全文，初亦由曼殊室利菩薩，請佛說諸佛名號本願功德，釋迦佛乃告曼殊室利：東方去此，過四殑伽河沙佛土，有世界名曰無勝，佛號善名稱吉祥王如來，彼佛國土，清淨莊嚴，乃至初發心時，發八大願等；此為第一大段之文。 

復告曼殊室利：東方去此，過五殑伽河沙佛土，有世界名妙寶，佛號寶月智嚴光音自在王如來，乃至彼佛初發心行菩薩道時，亦發八大願等；此為第二大段之文。 

復告曼殊：東方去此，過六殑伽河沙佛土，有世界名圓滿香積，佛號金色寶光妙行成就如來，乃至彼佛初發心時，發四大願，及見眾生苦惱，為除業障，即說神咒等；此為第三大段之文。 

復告曼殊：從此東去，過七殑伽河沙佛土，有世界名無憂，佛號無憂最勝吉祥如來，乃至彼佛世尊，行菩薩道時，發四大願等；此為第四大段之文。 

復告曼殊：從此東去，過八殑伽河沙佛土，有世界名法幢，佛號法海雷音如來，乃至彼佛行菩薩道時，發四大願等；此為第五大段之文。 

復告曼殊：東方去此，過九殑伽河沙佛土，有世界名善住寶海，佛號法海勝慧遊戲神通如來，乃至彼佛行菩薩道時，亦發四大願等；此為第六大段之文。以上六佛，初二佛各發八願；後四佛，各發四願；此總為卷上之文。 

其卷下之文，即從此娑婆東去，過十殑伽河沙佛土，有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來，從初發心，即發十二大願，且有咒語，皆與今本相同；惟藥師佛說咒後之經文，較今本稍異。今本咒後之文，明聞藥師佛名所獲之利益，而彼則皆明聞七佛名號之利益，此其不同一也。又彼於藥叉神將，聞七佛名號已，發願衛護是法。時諸天人之眾，有疑惑不信者，佛知彼等心念，即入驚召一切如來甚深妙定，十方世界六種震動，七佛應召來會證盟其事，為今本所無，此其不同二也。復次、七佛既來，即異口同聲，說大神咒，其咒名如來定力琉璃光，亦為今本所無，此其不同三也。其後、執金剛菩薩，與釋梵四天，復說一咒，亦為今本所無，此其不同四也。最後執金剛菩薩復說一咒，又為今本所無，此其不同五也。是故彼經共有五咒：即初、香積佛說除業障咒；二、藥師佛說消災咒；三、七佛說咒；四、執金剛與釋梵四天說咒；五、執金剛說咒是也。

 今大清龍藏中，尚有番字藥師七佛本願功德經，考其文義，與義淨所譯相同。昔人認作梵文，實為西藏文本，此諳藏文者，一見即知也。此西藏番字本，亦譯自印度梵文，故與義淨之譯相同，今存藏中，即在淨譯之下。今聽講所用民國十一年之甯波版本，其說咒語，與舊本不同者，即自番本中錄出。以其誤認番本為梵文，故抄錄之，然實非梵文也。如以『簿伽筏帝』為『八葛瓦帝』等，與西藏音相近，是其明證。又奘譯無咒，其咒乃自淨譯中添入，而義淨譯自梵文，故知今所誦之咒，乃唐譯梵音。 

如上所言五譯之同異，其藥師佛之文旨大同，而與七佛詳略差別。又中三譯無咒，前後二譯有咒，復加西藏之番字本；此為本經譯傳中國之略史。由是觀之，初帛尸梨密多羅所譯有咒，且屬大灌頂經之一品，則此經屬於密部。自第二、第三、第四，三譯觀之，既無咒語，復無說咒之文，則此經即近於淨土經典。迄至義淨之譯，前後五咒，則此經又屬密部無疑矣。由此五譯之相異，亦可窺見佛教流行變遷史之一斑。蓋帛尸梨密多羅來自西域，想其時西域密教已甚盛矣，而在印度、中國則未極流行。以宋、隋及唐玄奘時，印度中國皆大乘性相，法幢高建，故其譯此近淨土經也。及義淨時，印度密教復盛，故其譯時多添咒語，則此復屬密部焉。此在佛經翻譯史上，佛教因各處地域之異，各時趨勢之別，亦隨之而變易，然吾人亦正由是而可知佛教變遷之歷史與情勢矣。

 由上說來，知今誦講之流通版本，非全出玄奘所譯，其咒乃從義淨譯本增入；即文句亦間參揉淨譯，故今本可說奘淨二譯之合訂本。且民十一年之甯波版本，尚誤刊『厭』、『魔』等數字，及在觀世音菩薩等名上，增添南無二字，較諸舊流通本，不無出入。此乃總稽本經譯史之概要也。」

　　若此，玄奘大師翻譯之《藥師琉璃光如來本願功德經》，與義淨大師所譯之《藥師琉璃光七佛本願功德經》，前後年代相差近五十年，（玄奘大師於西元645年左右開始譯經，義淨大師則是於西元699年開始譯經。）其中，雖然有太虛大師所分析的差異，但是在藥師琉璃光如來的部份，實際上大同小異。若再詳讀善名稱吉祥王如來等六尊佛所發大願，便可進一步了解到，在玄奘大師譯本中所謂，何以稱藥師琉璃光如來一佛名號，便得如許功德勝利。

　　似乎可以這樣認為，藥師琉璃光七佛本願功德經中，七佛所發大願凡有四十，合併恭閱，即是一部藥師琉璃光如來本願功德經。

　　另外，此處所引用經文、祖師大德註解、名相解釋以及其他文章，縱有長至百千字以上者，亦直接列入正文中，不於文末作附註。但以標楷體為區隔，一見即知為引用文字而已。以藥師經法實包羅萬象，且可藉以閱讀相關經文，以及佛教諸名相解釋之故。