前身是室町時代的隈本城加以改建而成，安土桃山時代豐臣政權入主肥後國後，此城即當地藩主的官邸，面積達九十八萬平方公尺。

熊本城另一名稱為銀杏城，由於當加藤清正建造此城時，已經考慮到萬一發生圍城戰時，城內需要有食物供應，因此便廣植銀杏，甚至連城內地席的材質，都是利用芋艿的莖曬乾做成的，可以作為圍城戰時的戰備存糧。

 

明治時代前

文明年間（1469年-1487年），作為肥後守護菊池氏同族的出田秀信開始建築千葉城。熊本城歷史就此開始。

16世紀早期出田氏勢力衰退。在大永、享祿年間為菊池氏領地，由鹿子木親員建造隈本城，並將藤崎八旛宮進行遷宮的工作。1550年（天文19年）大友義鑑遭到家臣殺死。與義鑑敵對的菊池義武（義鑑之弟，以養子身份繼承菊池家）控制了隈本城。1554年大友氏攻佔隈本城，此後約30年左右由大友氏控制。

1587年（天正15年）豐臣秀吉完成九州征伐後，當時城主城久基移封筑後國。由秀吉家臣佐佐成政入主，成政不理秀吉指示進行檢地，導致了肥後國人一揆。1588年佐佐成政被責令切腹自盡，由加藤清正成為城主。

1591年加藤清正在茶臼山丘陵一帶開始建造城堡。約1600年（慶長5年）天守建造完成。關原之戰後清正成為肥後國52萬石大名。1606年築成完畢，翌年將城堡由隈本改名為熊本城。

1632年（寬永9年）由細川忠利取代加藤氏管治熊本藩。直到廢藩置縣為止，為細川氏宗家的居城。

明治時代及之後

在幕末時代藩內分為學校黨、實學黨及敬神黨三派。1870年實學黨以「戰國時代的遺物」向新政府提出拆城建議。但是拆除當天卻停止工作。

1871年廢藩置縣，熊本縣縣廳在城內二丸設置。同年縣廳改在花畑邸鎮西鎮台。駐守熊本鎮台後，將老朽化的櫓及多重櫓逐個拆卸。特別是西出丸石垣。在西南戰爭前，只俘留本丸主要部份的天守及本丸御殿。

1876年神風連之亂（亦稱敬神黨之亂）期間，反亂者太田黑伴雄控制了城內的砲兵營，很快被政府軍鎮壓。

西南戰爭時期，熊本城是政府軍的重要根據地，對抗守舊勢力西鄉隆盛所帶領的西鄉軍。不過在西鄉軍發動攻勢之前，其天守閣意外發生大火，火勢雖然立刻獲得控制，但是許多重要的文物、城樓已遭到燒毀。戰爭方面，政府軍在谷干城指揮下成功擊退西鄉軍，西鄉軍並沒有一人進入城中範圍內。

西南戰爭後直至大正年間，倖免於火災的另一部分城樓被陸軍逐個拆除。

1884年城內設置午砲台，使用空砲進行報時（1941年停止）。

1933年熊本城跡列為日本指定史跡。1955年列為日本的特定史跡。1960年慶祝熊本城350周年，熊本市籌得1億8000萬日圓重建包括大小天守、平櫓等。城內公園亦開始收費。而大天守內部為博物館。2007年建城400周年紀念，再將部份建築還原。







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 阿蘇神社

傳說阿蘇神社擁有2500餘年歷史。穿過阿蘇市内一之宮町宮地的街道，映入眼簾的是號稱日本三大樓門之一的大樓門。阿蘇神社裡供奉的主神是以阿蘇的開拓史祖-健磐龍命(神武天皇的孫子)為首的12尊神，全國供奉分神的奉齋社更超過了500間。

此外，這裡的參拜道路是全日本都非常罕見的橫向參拜道路(跟神社呈平行狀)。以神社為舞台展開的「御田祭」「田實祭」等一系列的農耕祭祀活動，在1982年(昭和57年)被指定為國家重要的無形民俗文化財產展。 　

另外，緊連著阿蘇神社旁的一之宮門前商店街裡，有一處名為「水基」的湧泉處，這裡的泉水水質甘純，當地民眾把它當成來自神明的恩惠般重視，並推崇其為長壽不老之泉。一之宮民眾的日常飲水一直都是來自這座天霖之泉。為了讓更多的民眾飲用這甘美之泉，10多年前開始設置一些木製、石製的打水處，供來往民眾飲用。您也可把這裡列入閒逛路線喔。

祭神 

神武天皇之孫健磐龍命（一宮）、其妃神之阿蘇都比咩命（二宮）等以下12柱神，總稱「阿蘇十二神」。

• 一之神殿（左手）
  • 一宮─健磐龍命
  • 三宮─國龍神（二宮之父）
  • 五宮─彥御子神（一宮之孫）
  • 七宮─新彥神（三宮之子）
  • 九宮─若彥神（七宮之子）
• 二之神殿（右手）
  • 二宮─阿蘇都比咩命（一宮之妃）
  • 四宮─比咩御子神（三宮之妃）
  • 六宮─若比咩神（五宮之妃）
  • 八宮─新比咩神（三宮之子）
  • 十宮─彌比咩神（七宮之妃）
• 諸神殿（最奧）
  • 十一宮─國造速瓶玉神（一宮之子）
  • 十二宮─金凝神（一宮之叔父）
• 全國式內社御祭神3132座