「自由門神」藉著一群生活在台灣基層社會的保守性格人物，透過他們的生活方式及思考方式，反映出台灣目前所處的環境。當然，這部電影的戲劇成份遠大於其紀錄性質，所以，劇情的發展與對白還是看得出來導演與製作團隊的巧思與企圖心。

本片描述由石英與文英所經營的「西唆米樂隊」(葬儀樂隊)，面對失去隊員與同行競爭的危機，不知如何改善，在僅存的兩名團員及長子阿輝（李康生 飾）幫忙下，賺取少許的利潤，勉強經營。加上阿輝對未來沒有計劃，小兒子阿明因小兒麻痺不良於行，個性古怪，以養鴿子逃避人際關係，封閉自己。
阿輝的好友阿狗（張瑞哲 飾）常帶阿輝出入PUB，他在一間鐵工廠當工人，因為一次機會進入豪華公寓裝鐵門，看見古董佛像讓他想起了村中小廟的兩扇門神，也許是有價值的古董。因此夥同阿輝盜取門神賣給了古董商黑面（楊烈 飾），
為錢鋌而走險的阿輝，是因為父親是植物人需要大筆療養費用。得到一次甜頭的阿狗，進而潛入豪華公寓偷取佛像，當他與阿輝再去找黑面時，卻發現黑面中槍身亡，阿狗撿起槍與阿輝逃離現場。
石英、文英與其兩名團員還有鄰居廟祝萬事通夫妻（陳博正與蔡閨 飾），一群人簽六合彩卻因組頭賴帳，組頭拿了幾張紐約七日遊的機票抵債，一行人於是前往世界之都紐約觀光。
這時阿狗又因為誤傷鐵工廠老闆，被認為與黑面案有關成為通緝犯。阿狗自認自己已沒有明天，於是前往療養院結束父親的生命再逃往阿輝家藏匿在鴿舍裡。而在紐約的一群人，卻意外的在義大利餐廳中發現村中的兩扇門神，經過交涉，店家讓他們將門神帶回台灣。
阿狗、阿輝與阿明在鴿舍聊天，卻被警察包圍。不知如何是好的三人，與警方起了衝突………………………。

從事西唆米的家族，以吹奏送葬樂曲為生，但平日生活表達的情緒方式卻不擅修飾，總是直來直往；他們的經濟狀況是現做現收；平日節省，但也會做做發財的小夢，所以，對統一發票到玩六合彩成了家庭娛樂。然而音樂卻也頃吐了他們內心純善溫和的一面，甚至到了紐約，這群人也以音樂，讓種族無國界的溝通，呈現出一幅世界大同的美景畫面。

「自由門神」除了音樂的隱喻之外，跛腳的鴿子與籠子裡的鴿子，都隱喻出故事的人物角色，阿輝與阿狗如竉子裡的鴿子，嚮往自由卻不知該往哪裡去，阿明如跛腳的鴿子，行動不便但卻相當有目標的活著，存下的錢為買一隻黑管，讓自己沉浸在音樂世界中。又廟與兩扇有門神的門，廟譬喻為台灣或是家庭，門神便是保護著國家的政策或家庭中保護子女的父母。片中一再出現著門被打開，鴿子往外飛走的畫面，導演所要傳遞的是人心渴望往外飛翔的心與自由感；導演一再經由演員的嘴闡述著，當廟沒有了門神就會有妖魔鬼怪侵入，沒有門的保護，一切會變得不同。當門被意外尋得時，就如同在茫然中找到希望一般。對家庭而言，父母就如同孩子的門神。劇中的阿狗本性不差，但他失去父母這對「門神」的關愛與管教後，才造成日後無法挽回的錯誤。

本片以一個逐漸式微的家庭，現代年輕人的價值觀和社會基層人物生活的悲喜、現階段大環境的變遷及人們不曾思考到的問題，以幽默又不失深刻的故事結構，訴說著自由門神的意涵。
在當屬於你的那扇自由之門打開之前，你真的已經準備好了嗎？或是，需要在這道門上畫上自我安慰的門神圖案？