愛滋病患者併發現鉅細胞病毒感染造成的腎上腺炎（adrenalitis）
的機會很高，但是臨床上發生腎上腺功能低下症的機會並不常見。當發生
功能低下時，病徵與非愛滋病患無異，但是死亡率可能較高，原因可能是
診斷較晚和患者常合併其它威脅性命的併發症。

針對以上鉅細胞病毒感染症的治療，建議的使用藥物是 ganciclovir
或 foscarnet。Ganciclovir 的使用注射劑量是，每公斤體重 5 毫克，
每日兩次。兩至三週後改為一日一次，或是改用口服 ganciclovir 或valganciclovir。

使用 ganciclovir 必須謹防骨髓功能抑制的副作用，特別是患者合併使用 zidovudine（AZT; ZDV）、TMP-SMX（Baktar、Bactrim）等容易引發骨髓功能
抑制藥物時。

長期使用注射用 ganciclovir，除了謹防骨髓功能抑制的副作用外，
還須小心留置中心靜脈導管（central venouscatheter）引發的菌血症或
靜脈炎。

當注射的 ganciclovir 效果欠佳時，應考慮是否 CMV 產生抗藥性，
若能證實已有抗藥性病毒株，可改用foscarnet。Foscarnet 的副作用，
主要是腎功能異常與電解質異常。

對於視網膜炎的治療，注射用藥效不理想時，可請眼科醫師施打眼內（intravitreal）ganciclovir。治療和預防再發使用期並不清楚。
但是要徹底防止再發，只有倚賴高效能抗病毒藥物，提升 CD4+淋巴球數。

只要 CD4+淋巴球數能持續上升大於 100/毫升達三到四個月以上，
就不虞鉅細胞病毒感染併發症再發。而針對預防初次發作，
因為foscarnet 或 foscarnet 費用昂貴、副作用多、給藥不便等，
專家並不建議使用預防初次發作。最好、最有效的預防初發藥物，
還是高效能抗病毒藥物。