教育部公佈了新的高中歷史綱要，第一冊臺灣史，第二冊中國史，第三冊和第四冊是世界史。其中以臺灣史中引入依舊金山合約而導出的「臺灣地位未定論」，以及孫文領導的中國革命劃歸「中國史」兩個，引發泛藍開始捍衛「孫文」，使其不致成為「外國人」，也使得泛綠公開力挺教育部的做法。

　　關於舊金山合約所導致的「臺灣地位未定論」出現，的確是許多人〈包括當時英國政府與美國總統杜魯門〉所持之見解，當然也有不同意見，對於各方說法，同時並存於歷史教材當中，顯是合理並客觀之做法，相較之下，原本國民黨政府所編訂之教材非但對於「臺灣地位未定論」隻字未提，更對舊金山合約視而不見，只提國民黨的片面主張─開羅新聞稿、波茲坦公告，顯然有失偏頗。

　　第二，教育部將高中歷史分為三大部分：臺灣史、中國史、世界史，此類區分法既區分出臺灣的主體性，且又迴避了對「本國」定義的做法，這顯然是極為細膩的政治操作，泛藍攻擊教育部的做法說是將孫中山視為外國人，可是這樣的前提必須是：中國史不是本國史。也就是說泛藍也認為本國史只有臺灣史而不包括中國史，所以導致被劃歸中國史的孫文是外國人，這樣只是剛好應合了臺聯主張將中國史納入世界史之中的論調，泛藍的主張顯然是無謀的攻擊，只是突顯了泛藍內心深處也已經承認本國即臺灣這樣的說法。

　　第三，我們在研究學問時，會與以分類研究，例如區分為自然科學、社會科學、文學等，自然科學會區分物理、化學、生物等，人無法窮究世界各種領域，所以才有需要分門別類來研究，就歷史這部分來說，我們會因地、因時區分研究內容，前者如：法蘭西史，後者如法蘭西史中的第二共和時期。研究歷史的第一個分類就是按地區來區分，其次才次時間，人類的歷史是分區在發展的，歷史的發展是有前後連貫性的，同一個時間內，探討不同地區的歷史並不具有意義，只有在同一地區前後所發生事件的因果關係才具研究討論意義。例如以埃及的歷史來說，埃及在西元前曾經建立過王朝，後來被亞歷山大所滅亡，之後又被羅馬帝國、大食帝國、土耳其帝國、大英帝國所統治，第一次世界大戰之後才逐漸取得獨立國家的地位，研究埃及的歷史，並不需要把亞歷山大帝國、羅馬帝國、大食帝國、土耳其帝國、大英帝國的歷史全部都納入，只需研究其與埃及有關的部分即可，將別國歷史中有關於本國〈本地〉的部分納入本國〈本地〉史中討論。研究香港歷史也是，必須將英國統治香港的一百多年部分納入，而其他的英國史便不適宜放入香港史置中。相同的，臺灣史的研究與教育，應該將荷蘭、西班牙、延平郡王、清帝國、日本、中華共和國的歷史中，有關臺灣的部分納入，其餘無關臺灣的部分，應放到其他歷史研究中討論。

　　最後，在陳水扁總統公開宣示：本國即臺灣的情況下，教育部把中國史從世界史中區分出來獨立成一單元，顯然是多此一舉，既然本國即臺灣，那中國史便是世界史的一部份，今教育部將其獨立成一單元似乎有公然違背「國策」之嫌，本人呼籲教育部應該要確實落實陳總統的本國即臺灣論調，將中國史併入世界史之中。