兩岸經濟合作架構協議（ECFA）實施後，兩岸關係呈現新情勢，多位台灣學者在一場高峰論壇的討論中認為，兩岸關係長期以來的互動中，政治與經濟本來就無法分開，政治氛圍考量經常制約與規範著兩岸經貿與社會交流的鬆緊；ECFA實施後，兩岸政治性議題將難以迴避。
前總統府副秘書長、海基會副董事長兼秘書長邱進益表示，目前兩岸之間的共識，就是兩岸之間的關係或談判是先易後難、先經後政、循序漸進、共創雙贏；儘管大陸對台灣的經濟儘量配合開放，但除非大陸對台獨疑慮完全消除，否則兩岸關係前進的速度與前進的可能性，會有滿大的困難。目前兩岸可以簽訂兩岸和平協議，因為只有透過和平協議的方式，才可以釐清大陸會對台動武的說法；相關時程最好是在ECFA及相關幾個協議達成後再考慮這個問題；至於中程目標，則應爭取“一國兩府”。我們認為，目前兩岸有共識，先易後難、先經後政，這是符合兩岸關係發展規律的，是目前兩岸的最佳選擇。但是，2012年開始應該是兩岸政治關係的新起點或者是轉折點。原因在於：一，馬英九如果連任，在未來的執政四年中仍不觸及兩岸政治性議題，說不過去，兩岸關係的發展形勢不容許，民眾不容許，政黨政治發展變化不容許，大陸方面也不容許。二，如果民進黨再次執政，延續扁朝政策，大陸一定會提前進入先政治後經濟的轉折階段，不太可能對完全反對一中、堅決走向台獨的民進黨大量輸送經濟利益，而無任何政治約束。(2011-05-02)