高鐵年底將新增苗栗、彰化、雲林3站，加上明年南港站啟用及新購4列車，總支出約200億元，學者斷言恐「入不敷出」，成為使高鐵財務惡化的最後一根稻草。另外，為擴大運輸，高鐵列車站站停，從台北到高雄的車程較現行還要增加18分鐘，外界要求「變慢降價」，但高鐵坦言有難度。

然而，總資產5010億元的高鐵，目前已負債4528億元，幾近破產，新增3站興建營運約多增加支出75億元，建南港站經費高達60億元，另添購4列車，整體支出逾200億元，連高鐵前董座歐晉德上個月受訪時都預言「一定賠死」。

逢甲大學運管系副教授李克聰也說，收入與支出不成比例是可以預見的，當初政府要蓋中長程運輸的高鐵，卻成了11站的四不像，3站新增後將讓高鐵財務雪上加霜，有可能成為高鐵財務惡化的最後一根稻草。