台南市一０四年流行的登革熱病毒為第二型病毒，但今年所發生的登革熱病例感染卻為第一型病毒，可能提高登革熱重症的風險，市府、民眾及醫院所應提高警覺。 
一般感染登革熱的病人，不見得有明顯發燒、頭痛、骨頭肌肉劇烈疼痛等症狀，且容易誤當為一般感冒治療，易錯失即早診斷時機，導致登革熱病毒於社區傳播。像九月十八日被疾管署發布確認本土性登革熱個案，他發燒曾前往診所看診，惟醫師並未發現係感染登革熱，而後因出現紅疹前往醫院就醫，才被通報疑似感染登革熱，送驗才確診。 
衛生局特別提醒醫療院所醫師，於病患就醫時，提高警覺，若發現登革熱疑似個案，應立即通報，以利衛生機關及時採取防治措施，避免疫情擴大。另也提醒有慢性、免疫系統疾病或曾感染過登革熱的民眾，需提高警覺，避免再次感染而造成登革熱重症，影響生命安全。
  此外，在中秋節連續假期期間，因颱風來襲挾帶豐沛雨量，市區已造成多處積水及積水容器，雨後一週為登革熱防治關鍵期，衛生局也籲請民眾，務必落實清除家戶內外積水容器，確實做好「巡、倒、刷、清」，並社區動員進行社區容器減量等防治工作，勿因積水容器孳生孑孓導致受罰，並增加染病風險。
  此外，東南亞國家仍有登革熱疫情，請民眾前往旅遊時，需做好防蚊措施，如有發燒、頭痛、後眼窩痛、關節肌肉疼痛、出疹等症狀，應儘速就醫，並告知醫師旅遊史、活動史等相關資訊，以利疫情防治。
  依據疾管署公布全國截至九月十八日止，今年本土登革熱確定病例共計三七七例，其中高雄市三四二例、屏東縣二十例、台南市九例，台南市病例數比起去年上萬例相較，顯示防治有成效，惟目前是登革熱疫情高峰期，市府、民眾與醫療院所絕不可掉以輕心，以免稍一不慎再度擴大疫情。