雖然困難腸梭菌在社區傳播的個案數較少，它卻是院內感染的頭號殺手。許友恭說，困難腸梭菌一旦跑出人體腸道，在惡劣的環境裡，會改變生存方式，以孢子型生存下來，好像身體外面罩了一層金鐘罩，怎麼殺也殺不死，連酒精、消毒水也殺不死，除非用漂白水、雙氧水才能殺死它。

在國外遇到此類病人，通常會給患者獨立一間病房，以免傳染他人。困難腸梭菌屬糞口傳染，任何狀況下，都有可能把細菌帶到病房，再附著於醫院病床門把各角落；抵抗力差的病人一旦接觸，細菌就有可能從嘴巴進入腸道，此時若病患腸道生態不平衡，身體抵抗力不佳時，困難梭菌就會乘機作亂，引發嚴重偽膜性腸炎。

根據統計，偽膜性腸炎每年在美國就有三百萬人次感染，患者會引起嚴重腹瀉、大腸發炎，甚至死亡，且感染率有逐年增加的趨勢，目前歐洲及美國已被疾病管制局列入通報。目前國內並沒有確切統計數字，保守推估，台灣每年約有一萬五千名患者被感染。

據林口長庚、振興醫院、三軍總醫院感染科觀察，困難腸梭菌確實有增加趨勢，由於其症狀為下痢，很容易被忽略。過去在三總就曾發生一個案例，一名八十幾歲的老伯伯接受肺部手術後引發肺炎，住院四周，服用了一堆抗生素，卻出現腹瀉、發燒、脫水，甚至一度引起敗血症，經檢查發現，老伯伯是因大量服用抗生素，使腸道成了困難腸梭菌的溫床，而引起嚴重的偽膜性腸炎。

三總感染科主治醫師王甯祺強調，有些患者疑惑「為什麼吃了抗生素之後常常要跑廁所，而且有腹瀉的情形，偶爾會有一點小發燒，是不是吃了不乾淨的食物造成？」其實多為一種「困難腸梭菌」影響腸發炎所致。病患通常是在院內感染，老年人及免疫功能缺乏的病人最危險，症狀包括腹瀉、發燒、脫水、電解質流失、敗血症、休克甚至死亡。