天然石材最常見的病變約可分以下幾類：

水斑：
石材表面濕潤含有水氣，使石材表面產生暗沉的病變現象，影響石材的美觀。主要是因為石材本身吸水率及孔隙率偏高，或石材安裝時靠近於水源處且未施作防護劑做防水處理，或不按照正確的施作方式，以及在安裝時水泥沙漿及水灰比例過高等不當因素。

白華：
即是在石材表面或在填縫處有白色粉末—解析出的污染現象。此種病變現象常發生於戶外或水源豐沛處。當石材以濕式工法安裝時，背填水泥沙漿中的氫氧化鈣等鹼性物質，被大量的水解離出來，由毛細管滲透至石材表面或填縫不實之處，氫氧化鈣再與空氣中的二氧化碳或酸雨中的SO2化合物反應，形成碳酸鈣或是硫酸鈣，而當水份蒸發時，碳酸鈣或硫酸鈣就結晶解析形成白華。

銹黃：
通常銹黃發生的原因可從三方面來討論，第一、石材本身含有不穩定之鐵礦物（硫化鐵最不穩定）所發生的基材性銹黃，即原發性銹黃；第二、石材加工過程中處理不當所產生的銹黃；第三、安裝後配件生銹的污染。

吐黃：吐黃一般產生的原因有

1. 使用瞬間膠。
2. 防水不良水分過高。
3. 高鹼水泥砂漿引起的反應。
4. 石材本身有裂痕或黏土材質。
5. 空氣不流通透氣不良。
6. 打臘影響石材透氣。
7. 石材本質較敏感或含鐵質。