為配合我國加入WTO及貿易自由化，海關關務會報中建議各輸出入簽審機關參酌各先進國家作法，全盤檢討刪除或簡化邊境管理事項及貨品項目，並採風險管理理念，僅對必要者施予邊境查核，其餘移至境內查核，以降低非關稅障礙。

　關稅總局指出，我國加入WTO後，進出口邊境管理事項及貨品項目，如大陸物品、部分應施檢驗品目、其他通關輸入規定等，在通關點上的查核案件，應可減少或簡化，各相關簽審機關應檢討現行邊境管理貨品項目，對於嚴重影響通關，在邊境查核無實益者，儘量移至境內查核。同時，為加速守法廠商通關，海關請各簽審機關採取風險管理，儘量只對危險群廠商才實施邊境查核。

　由於目前行政院環保署、農委會等，對於部分特定貨物進口，規定進口人若非許可證之持有者，應加附持有者之授權文件，或於證之影本上加蓋授權使用章，但因海關電腦檔並無相關授權資料，對於進口人是否經許可證持有人授權，無法比對，必須採人工審核，但人工審核又無法辨識授權真偽，甚至遭檢調或監院質疑，因此由海關查核授權的作法顯無實質意義，且授權與否涉及私法上的權利義關係，關稅總局認為實不宜由海關代為查核。