高雄關稅局審查通過科學城物流公司進出、口貨棧（設於臺南科學工業園區內）全面自主管理，並自本（十一）月十日起實施，實施初期，海關仍將酌留關員輔導處理貨物進、出站作業相關事宜，為期三個月至半年。截至目前，高雄港管制區內倉儲業者僅剩下一家因故尚未通過自主管理審查，達成率已達百分之九十五。

目前高雄關轄區內已有長榮海運、陽明海運、萬海航運、東亞運輸倉儲（代理現代商船）、高鳳企業貨櫃儲運、亞太儲運（代理台灣韓進通運）、台灣東方海外、高鳳企業貨櫃儲運、華儲高雄分公司、臺灣快桅船務代理公司、美商美國輪船高雄分公司、友聯儲運、遠森網路科技高雄營運處、連海裝卸承攬公司、高群裝卸公司等十餘家業者實施全面自主管理，實施過程順利。

　高雄關稅局昨天表示，倉儲業者自主管理是海關目前施政重點之一，對於實施全面自主管理之倉儲業者，免徵「特別監視費」及減半徵收貨櫃（物）封條「加封費」；實施自主管理但設置於內陸（非港內管制區）之聯鎖貨棧、貨櫃集散站業者，免徵「業務費」。

由於「進口貨櫃動態查核系統」規劃是採用自主管理作業方式，為配合系統上線實施，凡符合自主管理條件之倉儲業者均可提出申請。高雄關指出，自由貿易港區設置管理條例通過後，為加速貨物進出自由港區流通，降低貨物流通時的行政管制，可預期目前已通過審查獲准實施自主管理的倉儲業者，其營運效益勢將大幅提升。