美國海關未來進駐高雄港執行CSI貨櫃安全檢查作業的確實辦公地點，將位於高雄關稅局前鎮分局，該分局除將建置機動式貨櫃檢查儀，原政風室的辦公室將予空出，免費提供美海關人員使用。由於機動式貨櫃檢查儀建置案，自從遭立法院刪除後，九十三年已無預算額度可供調撥，經建會已建議由財政部以專案逕報行政院撥款，關稅總局目前已積極處理中。

　美國海關已於去（二○○二）年十二月，要求全球航商輸美貨物須於出口櫃裝船前二十四小時傳輸艙單資料，不得以一般貨物申報，目前全球二十大港口僅剩高雄港尚未完成CSI簽署，而貨櫃檢查儀是CSI計劃中具關鍵性影響的重要配備，若經費不足以供海關完成配置，勢將影響美台海關展開CSI計劃的時程，甚至不排除將出現美海關只「簽署」但不執行的狀況。

　海關預估，三部機動式貨櫃檢查儀，總預算約為新台幣三億元，另包括貨櫃檢查儀場所配置、場地取得、相關法規研擬、培訓操作人員、預定建置進度，目前海關均已展開作業。美國海關進駐來台後執行的CSI，將針對出口及轉口貨物進行電腦篩選，轉口部分短期將由海關人工控管，透過海關櫃動系統與已註記控管，長期則將規劃建置海運進口艙單篩選系統。

　至於出口部分專家系統短期也將由海關關員人工控管，美國派駐四至六人至高雄港，我國原則上視需要派駐三人至美國港口。基於互惠原則，美國亦將免費提供我國關員辦公處所。