營業人進口貨物因該貨品有瑕疵予以退貨，此類案件在退運出口時，係向海關申報外貨復出口，出口報單類別為「Ｇ３外貨復出口」，統計代碼為「82已完稅或保稅工廠、加工區、科園區進口之外貨因故退運出口不再進口」，如果已向海關申請並經核准退還原代徵之營業稅，營業人應自行填寫「海關退還溢繳營業稅申報單」，並於營業稅申報時，填入申報書「進項退出及折讓」欄位（申報書４０、４１、４２、４３欄位），如此將補繳原扣抵的代徵營業稅款；然部分營業人因手續繁瑣，於退貨出口時，並未向海關申請退還該筆營業稅款時，營業人於申報營業稅時，僅需將該筆退出申報於進項總金額欄位之減項（申報書４８、４９欄位）以維持進項資訊之完整，至於該筆代徵之營業稅款，雖因原先業已申報扣抵，既然未向海關申請退還，自無須再申報補繳。