小規模營業人查定課徵之營業稅繳稅方式有6種:
(1)2萬元以下稅款可赴便利商店繳納
(2)赴金融機構以現金或支票臨櫃繳納（郵局不代收）
(3)辦理存款帳戶長期約定轉帳
(4)使用自動櫃員機(ATM)
(5)信用卡繳稅
(6)以晶片金融卡透過網際網路轉帳納稅營業人
上述6種方式中使用轉帳繳稅是最省時又方便的作法，營業人可以利用在郵局或金融機構開立之帳戶辦理【合夥事業限負責人之存款帳戶；獨資事業則可以負責人或其配偶之存款帳戶】，只需填寫繳款書上所附印之「委託轉帳代繳稅款約定書」廣告回執聯，或至財政部稅務入口網自行下載約定書，填妥並蓋用印鑑章後，寄回國稅局即可辦理；該局提醒營業人，申請轉帳繳稅必須在稅款開徵起日2個月前提出，下期開徵之稅款才可以適用，若負責人變更時，則須註銷原轉帳繳稅之帳戶，重新申請。