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公司清算人依規定負有申報清算所得的義務，若有清算所得而未依法辦理申報及繳稅，逕向法院聲報清算完結備查，清算人即有公司法第92條但書及第331條第3項但書規定之不法行為，自亦不生清算完結之效果。

【舉例說明】
甲公司於92年間進貨未依規定取得進項憑證，且同期間銷貨漏未開立統一發票，漏報營業收入，經國稅局查獲，除補稅外，並處以罰鍰。甲公司不服，主張公司已清算完結，並經當地地方法院准予備查，國稅局不得對法人人格消滅之公司課徵稅款及處罰等由，提起行政救濟，惟遭高等行政法院判決敗訴。
行政法院判決理由指出，甲公司確有進貨未依規定取得進項憑證，且同期間銷貨漏未開立統一發票，漏報營業收入，且國稅局已依法向甲公司之清算人申報債權在案。依相關規定，甲公司向法院聲報清算完結，僅為備案性質，並無實質上之確定力，是否發生清算完結之效果，應視是否完成合法清算而定，因甲公司仍有多項清算事務未了，而未完成合法清算，則其法人人格仍視為存續，稽徵機關對其追繳營業稅及處罰，並無違誤，因此判決甲公司敗訴。