營利事業申報佣金支出時，應依營利事業所得稅查核準則第92條規定，提示雙方契約，或其他居間仲介事實之相關證明文件，俾供國稅局核實認定。因此有無支付佣金之必要，應以代理人或代理商有無實際提供仲介勞務為斷。

【舉例說明】
某公司營利事業所得稅結算申報案，發現該公司申報佣金支出355萬餘元，佔該公司部分外銷貨物價款約9﹪，該公司雖提示雙方仲介合約書及結匯證明，並說明係為獲得更多訂單，故支付較高比率之佣金予代理人，惟該公司無法進一步提示與該仲介者洽商過程、詢價、報價等具體仲介事實之證明文件，國稅局以其無法證明仲介事實，且未能證明所支付佣金確屬營業所必要予以剔除佣金支出並補稅。

申報佣金支出除有支付佣金之事實外，並需有仲介銷貨事實，以證明該項佣金支出確為營業所必要及確屬合理費用，而非形式上具備合約書或結匯支付證明，即可列報佣金支出，仍應提示仲介者確有提供仲介勞務之證明文件，如洽商過程中之詢價、報價及收受訂單等各項書面憑證及往來函電文件，國稅局始能據該仲介事實，進而審核支付之佣金是否確屬營業上所必要之費用。營利事業應妥善保存交易相關原始憑證，如往來文件傳真、書函及足資證明仲介事實之文據憑以認定，避免日後因舉證困難而影響權益。