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近來發現多件營利事業遭受不可抗力災害導致帳簿憑證滅失，因未依稅法規定的期限併同災害損失報請稽徵機關派員勘查，雖如期辦理結算申報，但因無法提出帳簿憑證，又無法提出帳簿憑證確實遭受不可抗力災害滅失之證明，遭依同業利潤標準淨利率核定營業淨利。

稽徵機關進行調查或復查時，納稅義務人有提示有關各種證明所得額之帳簿、文據之義務；如未提示，稽徵機關將依查得之資料或同業利潤標準，核定其所得額。營利事業遭受不可抗力災害以致帳簿憑證滅失者，須報請稽徵機關派員勘查屬實或提出確實證據證明屬實，若不符合上述規定，致未能提示帳簿、文據，應依同業利潤標準核定所得額，對納稅義務人相對不利。

營利事業遭受不可抗力災害導致帳簿憑證滅失，切記應於稅法規定的期限併同災害損失報請稽徵機關派員勘查，始能於稽徵機關查核當年度結算申報案件時，適用營利事業所得稅查核準則第11條第2項規定，依該營利事業前三年度經稽徵機關核定純益率平均數核定所得額，此舉相較於未報備而逕以依查得之資料或同業利潤標準，核定其所得額更為有利，納稅義務人千萬不可輕忽。