大藏寺原本設在竹叢中，民國六十九年，台東佛教蓮社瑞麒法師弟子釋宏法到此購地建寺，欲闢為一靜修道場，後逐步擴建，乃有今日開闊寺垣、清幽環境。由於宏法法師已往生，目前住持為釋開昇，監院為釋宏寬。

大藏寺旨在成為清修道場，故除七月孟蘭盆法會外，並沒有其他活動；不過，來自各地的出家眾雲遊到此，經常會在此羈留，或久或暫，真正常駐者則監院、住持師叔侄二人，凡事皆必躬親。平日空閒時務農，在寺旁種有數種水果，作為經濟來源。

第二代師父的志願是能夠供十位比丘進修，他們不提供團體進修，只提供男眾修行。進修唸佛法(台語)主修課為『南無大院地藏王菩薩願力』與『南無大悲觀世音菩薩願力』

民國七十年間，因大藏寺三帥父（上開下寧）善治素齋，名聲遠播，凡茹素者皆趨之若鶩。宏法師往生後，三師父亦他去，寺中不再以齋飯待客，寺殿頗顯清寂。不過對有心修行者而言，於大藏寺舉目所見，蔥籠翠綠，足以開人心胸、啟人佛性。每年夏日也有少數學子借此地研讀功課。

大藏寺大雄寶殿內供奉三寶佛，同祀者為觀音佛祖。