福田口岸聯檢樓與香港落馬洲口岸聯檢樓通過長204米、寬16米的通道橋相連，實現無縫對接。
該通道將深圳地鐵4號線和香港地鐵落馬洲支線連接起來，成為唯一連接深圳、香港兩地地鐵的通道。
在聯檢樓內部，共有4座提升高度達12米的自動扶梯。旅客可通過該扶梯直接由一層的夾層進入三層的離境聯檢大廳。其中，一層的夾層也與地鐵皇崗站相連。
目前，深圳地鐵四號線皇崗站至少年宮站單程運行10分鐘，行程間距10分鐘。共開通少年宮、市民中心、會展中心、福民路和皇崗站五個站，其中會展中心站是與一號線的換乘站。據悉，福田口岸開通後，深圳旅客自深圳地鐵會展中心站上車到皇崗站轉車過境、再到香港中環下車不過40分鐘，大大縮短了深港之間的距離。
深圳灣口岸（又稱深港西部通道）由一條長五千五百多公尺的深圳灣大橋銜接香港與深圳，香港端在元朗區的鰲磡石，深圳端在蛇口東角頭。大橋自二○○四年一月動工，今年四月完工，耗資近十億港元。為減輕橋身對海流的影響，以及避免直線車速過快，大橋走線以「S」形設計。此外，大橋外觀優美，共十二對斜拉索，且呈不對稱布置，是大陸唯一傾斜的獨塔單索面橋。
深圳灣口岸的聯檢大樓位在深圳境內，是首度採用「一地兩檢」的模式，今後通關旅客，只需在聯檢大樓內檢查一次證件即可過關，不必在香港境內再檢查一次，有別於現在皇崗口岸的作法，大大方便旅客通關，不必上上下下，折騰兩次。深圳灣口岸設計日處理五萬八千輛通關汽車，比現有的皇崗口岸多四倍，將是大陸最大的通商口岸。
另一個新的口岸─福田口岸位在皇崗（香港這邊稱落馬洲）旁邊，是人員通行口岸（類似羅湖）。這處口岸通道由深圳地鐵四號線與香港地鐵落馬洲支線連接起來，預計二○○九年全面對接（香港落馬洲地鐵今年先完工通車），成為唯一連接深圳香港兩地的地鐵通道，將來旅客只要站在人行扶手電梯上，不用移動即可過境深港。
福田口岸設置八十條查驗通道，最大日客流量可達卅萬人次，超越世界最大通關客流量的羅湖口岸設計量，可望成為最大的客運口岸。
由於珠三角一帶台商遍布、加上眾多的台灣遊客，經常經由香港過境深圳到大陸，兩處新口岸啟用後，不僅能舒緩龐大的港深通關客流量壓力，對經常進出香港深圳的台灣旅客也更方便，尤其深圳灣大橋七月通車後，經香港赴深圳寶安機場，或至台商大本營東莞市，都會節省一些時間。
以前一般坐巴士到上水，转坐九广东铁到深圳过关，一般一路上要耗时两个半小时。西部通道开通后，经深圳湾公路大桥，从香港到深圳车程不到20分钟
　　目前，深圳地鐵四號線皇崗站至少年宮站單程運行10分鐘，行程間距10分鐘。共開通少年宮、市民中心、會展中心、福民路和皇崗站五個站，其中會展中心站是與一號線的換乘站。據悉，福田口岸開通後，深圳旅客自深圳地鐵會展中心站上車到皇崗站轉車過境、再到香港中環下車不過40分鐘，大大縮短了深港之間的距。
http://www.kcrc.com/html/tch/corporate/new_projects/lok_ma_chau/index.asp
据悉，福田口岸为香港通往内地的第2个铁路口岸，落马洲支线开通后，旅客办理完过关手续便可直接接驳深圳地铁到深圳市区。地铁线路已于6月底率先开通。除地铁外，位于福田口岸西广场的公交车站目前已开通3条线路，目的地分别为东昌及紫薇阁，途经岗厦、华强北、东门等地，票价为1.5元至2.5元不等。
香港落馬洲新口岸15日16時啟用 初期日運作16h
香港市民往返內地即將再多一個快捷途徑可供選擇！落馬洲支線管制站鐵定於本月15日(星期三)下午4時正式開放使用，落馬洲支線公共運輸交匯處亦會同時運作，為往返內地的旅客提供各種公共運輸服務。管制站初期每天運作16小時；通關3個月後進行檢討，研究是否需要將閉關時間延長至午夜。
落馬洲支線管制站是繼羅湖管制站之後，第2個連接鐵路服務的管制站。香港運輸署經已宣佈，落馬洲支線管制站及其公共運輸交匯處將於本月15日下午4時正式啟用。落馬洲支線管制站在啟用初期，每天通關16小時，由早上6時30分至晚上10時30分，以便旅客能儘量利用深圳地鐵四線晚上11時的尾班車。
港府發言人昨日稱，落馬洲支線管制站啟用後，旅客可以利用多種公共運輸服務經該新管制站往返內地，旅客除了可以乘搭東鐵落馬洲支線往來落馬洲支線管制站外，亦可以乘搭專營巴士、專線小巴及的士往來設于落馬洲支線總站旁的公共運輸交匯處，經管制站辦理過境手續。
　　深港雙方在管制站啟用3個月後，再根據管制站的運作情況及旅客流量等因素，評估何時把通關時間延長至午夜零時。港府發言人提醒市民，由於落馬洲支線管制站位於邊境禁區，前往該管制站的過境旅客必須持有有效的旅遊證件，非過境人士則必須持有有效的邊界禁區通行證。