馬偕博士當年來台，除了在淡水宣揚基督教義，同時也懸壺濟世、行醫助人。因免費義診而來求醫的人愈來愈多，1879年獲得一美國婦人捐款，蓋了台灣第一所西醫院，就是「滬尾偕醫館」。1901年馬偕博士辭世，1912年「馬偕紀念醫院」落成使用，滬尾偕醫館便功成身退。此後，醫館院舍先後充作神學院、圖書館、幼稚園和學生宿舍之用，建築體也翻修多次，至1992年整修完畢而成今貌。
此醫館為馬偕所設計，為閩南式民宅，卻有西洋門窗，兩相對照十分有趣。外貌樸實，目前仍保持初建之樣貌，館內並保有一些馬偕博士行醫時之醫療器材，如：早年的病床、手術洗濯台、藥罐、拔牙工具，以及壁爐、門鐘、風琴、餐桌等家具。偕醫館醫務遷移後，它作為教會書房、後作為教會使用、租給他人當醫院，二次大戰後成為幼稚園校舍至今。經過淡水馬偕街，就算不進去，看看醫館外觀，也能發思古之幽情。
開放時間：外部開放參觀，內部除遇教會禮拜時間及舉辦活動外，平時不開放。