交通部航港局副局長李雲萬昨在立法院備詢時表示：

海研5號不是「點」觸礁而是整個「面」被礁岩劃破，從航跡圖搭配船本身的資料研判，全長72.6公尺的海研5號當時沿著礁岩滑行達15秒，船底有約50公尺與礁岩接觸被劃破40餘公尺長，三層艙門都破洞造成大量進水船才會沉得那麼快，海事調查確定有人為疏失將召開評議委員會對船長與船員進行的後續懲處，預計農曆年後公布結果。

科技部次長兼代理部長林一平指出：

海研5號沉船後有13個既定的研究計畫受到影響，將由即將陸續汰換的海研1、2、3號替代執行，為彌補海研能量的空缺預計在2年內以6億元的經費外購1艘2000噸級研究船，待15億的保險理賠金完成後再將其規劃做為自建3000、1000噸與500噸級研究船各1艘的經費，並在數年內建置總共5艘的海洋研究船隊。

國研院院長羅清華表示：

若遠洋研究計畫無法順利執行時，則考慮先租用外國現成的研究船，只要海軍有意願合作借調軍艦也是選項之一。

海研5號在內15秒被劃破40米??

當時的時速是飆到多少??

撞進礁棚多深的距離才會造成這麼大的損害??

海研船一般都是20mm鋼製船殼，再差的也是20～40mm的鐵殼船，為的就是要防止被海底的各種怪東西割破船底，那我們的海研船的船殼是用什麼鳥材質製造，這麼的弱不經風一撞就破還沉的那麼快??

詳細報告應該要盡快的公諸於世，除可解眾疑外還能集思廣益以為後續研究船的改進提供意見。

租用外國研究船來為我國進行海研計劃最好是連考慮都不要，最好直接由政府下令海軍借調狀況較差的成功、濟陽、錦江級軍艦各2艘，拆除大部份武器留下聲納等裝備後進行包括引擎在內的大改裝，等各級海研船自建及購買完成後海軍還能將這6艘艦回收作為新裝備的測試艦使用。

如此一來海軍除了可以多出6艘新式裝備測試艦，更能避免去租到外國間諜船偽裝的海研船，把我國不可告人的海底秘密給偷走了。