具有變彩的蛋白石，其色澤可分為兩部份來討論，首先是其本體色，其次是變彩彩斑（Play of Color）．而其價值高低也是依這兩部份來評斷．

蛋白石的本體色，較常見的為白色，黑色，橘紅色，透明無色幾種．

白色的蛋白石是市面上較為普遍的，而若白蛋白上沒有彩斑，則稱為波次蛋白石（Potch），沒有商業價值．

但通常，所謂的黑色蛋白石並不必得呈墨黑色，只要本體色呈深色，一般也都歸類為黑蛋白．

橘紅色的蛋白石稱為火蛋白 （Fire Opal），主要產於墨西哥，因其氧化鐵含量的多寡，使得顏色呈現深紅色至淺黃色的不同色調．

用在寶石上的火蛋白並不一定要有變彩，若火蛋白的顏色呈現飽滿的橘紅色，則已足以切磨成刻面寶石．火蛋白甚至被視為橘色寶石的代表．

一般寶石的價值有絶大部份來自其重量，蛋白石則不然，其變彩的因素，比其重量因素還重要．

因此，即使較小的蛋白石，如果其上變彩強烈美觀，價錢可能會比更大但變彩不強的蛋白石貴上十幾倍．

在電子顯微鏡下，可看到蛋白石的結構是由整片的球狀微粒矽土排列構成的，如果此片區域的微粒矽土的大小相同，則會因此結構而產生光的繞射現象，構成了蛋白石的變彩．

若是球狀微粒的大小不一，就無彩斑產生；而當整片球狀微粒的大小一致時，顆粒的大小就決定了能通過這片區域的光之波長，也就是彩斑的顏色．

一般而言，紅色彩斑較藍綠色彩斑稀有，價格也較高，除此之外，彩斑所佔的區域越大，價值也越高．

另外，由於硬度不高，也有一定的軔性，變彩較不亮麗的蛋白石也蠻適合做為雕刻之用．

蛋白石常可見侵入與取代的現象，這與其非晶質的特性有關．

所謂取代，指的是化石埋在地底時，剛好有蛋白石礦脈經過，而原本化石的成份，就一點一滴被蛋白石的成份取代，但是，岩塊本身還維持著化石的紋理．

澳洲的蛋白石礦區所在的位置，原本是被海水覆蓋，因此，也產出許多被蛋白石化的貝殼．

侵入現象則是當蛋白石礦脈經過礦藏時，流動的蛋白石進入了礦藏的裂縫之中所形成．將這種蛋白石侵入鐵礦或其他礦藏的原石，切割打磨，會使其呈現特殊圖案．

由於仍包含了母岩的部份，此種蛋白石因而被稱為礫背蛋白石（Boulder Opal）．

無變彩的蛋白石，雖一般泛稱為波次蛋白石，認為無商業價值，但亦有部份是為市場接受的，常見者除了前述的火蛋白外，還有藍色及粉紅色的蛋白石．

藍色蛋白石的顏色與矽孔雀石相似，呈藍綠色，但比重較輕，且較為不透明．

從作成珠寶飾品的方向來考量時，蛋白石有著兩項缺點，其一是硬度過低，只有5到6左右，容易在配戴時磨損；另一缺點則是其含水份的特性，使其在加工加熱時，容易變質，造成彩斑消失或產生裂痕．

而由於蛋白石可能因缺水而產生裂痕，產地在開採後，會將蛋白石放至正常環境下數個月後，確定其質地較為穩定，不會產生裂痕，才將其做寶石之用．所謂蛋白石要放在水中養的說法，其實指的是質地較差的蛋白石．

總體說來，雖然在加工時較為困難，但蛋白石卓越的變彩，其他寶石無可匹敵者，使其成為相當受歡迎的寶石．

優化處理

蛋白石較常見的優化處理為層成石，有分二層石和三層石兩種(Doublet or Triplet)．

所謂的二層石，是將一片薄的蛋白石貼在另一材料的底托上，此底托通常選用黑色的瑪瑙，因其硬度夠，且上層的蛋白石在黑色的背景襯托之下，更能見其變彩．

三層石則是在蛋白石層上，再加一層水晶，以做保護之用，若用放大鏡觀察，常可在水晶與蛋白石之間發現被擠壓的氣泡．

層成石的價格比起原本的蛋白石低得多，且又有底托及上層水晶的保護，很適宜用做首飾．

澳洲的安達莫卡蛋白石(Andamooka Opal)，其優化處理仿照了黑瑪瑙的染色處理方式，內容相當有趣．

開始的步驟先將安達莫卡蛋白石浸入温糖水中，之後風乾，使糖份進入母岩孔隙；再將母岩置入硫酸中，糖的化學式是C₆H₁₂O₆，碰到硫酸後會脫水，只剩下黑色碳粒(C)，如此便將母岩染黑了．