環保署主任秘書符樹強表示，日月光事件後，環保稽查與《水汙法》將有重大改變，並提出五項要點：

第一、抽樣確實，而不是交差了事，倒果為因。第二、一旦發現違規立即處理，避免「養案」。第三、以前暗管偷排三次才勒令停工，往後一次就立即停工。第四、深度追討不法利得，金額往上提高。第五、事後發立刻進行假扣押處分，避免廠商捲款潛逃。

立法委員許忠信表示，追討不法利得「就像叫小偷把偷走了東西還來」沒辦法達到懲罰效果，罰款應該提升至不法利得的2至3倍。另外許忠信也批評環保署委外稽查比例過高，民間機構沒有公權力，根本不敢惹廠商，應該將高達4億多的委外預算收回公務體系，也增公務員就業機會。