由於此次北北基聯測主辦單位嚴重高估申請入學的門檻，以致發生數千考生高分低就的離譜事件。原本置之不理，還一直宣示堅持續辦的郝市長，雖然在事發一個月後才心不甘情不願地出面道歉，並發布改分發的補救辦法，使得將近一萬七千多名考生得重新分發。

    但豈知消息一出，卻激起考生與家長更大的怒火，尤其是參加二次基測的考生，擔憂理想學校的錄取名額勢必因此受到限縮，權益受損。原本規定參加申請入學的考生一旦錄取便不得更改，所有的名額必須留給參加二次聯測的考生依成績分發的考試辦法，卻被制定該辦法者自打嘴巴式的予以隨意變更，知法犯法，顧此失彼，進退失據，讓數萬名考生無所適從，釀成台灣教育史上最大的笑話。

    但是郝市長雖因北北基聯測這個影響並排擠全國其他縣市考生權益至鉅，且缺乏教育最基本應具公平性的四不像區域聯招，遭逢任內另一次非常嚴重地信任危機，但也許由於郝市長本身承襲了家族盛氣凌人的軍頭家風，從執意在“冬季”舉辦花價虛報連連且花錢如流水的花博，不惜與學者專家、媒體互槓伊始，到此次北北基聯測風波，橫柴入灶的態度始終如一，根本不把考生與家長切身的感受與意見聽在耳裡。

    一本一綱，缺乏多元學習且大開教育倒車的北北基自辦聯測，原本是在95年扁政府執政期間由藍色執政的縣市首長﹝台北縣市與基隆市﹞在政治鬥爭的考量下，由郝市長帶頭聯手所故意設計來與當時的中央政府互別苗頭的「一國兩制」怪獸。如今東窗事發後，其正當性與公平性受到各界強烈質疑且反對聲浪不斷，但是「郝教頭」就是不為所動，全當作馬耳東風，至今仍然認為獨立於全國教育制度體系外的北北基獨立招生是對的、是可以減輕學生升學壓力的好方式，並堅持續辦到底；對於此次風波，只承認技術錯誤而非政策錯誤，但是所謂對在哪裡？能減輕學生負擔的理由在哪裡？卻說不出個所以然來，與身歷其間的學子之感受完全背道而馳。