中央研究院發表醫療保健政策建議書指出，將安全且具成本效益的新藥，及新醫療科技納入全民健保的給付，短期內可能增加保險支出，但長期必因處置效率提升，重大疾病的減少，以及病患痛苦程度的降低等，而使醫療品質提升與整體醫療費用降低。除此以外，新藥及新生物科技的廣大國際市場，亦可帶動國家整體經濟發展。

    　中研院指出，全民健保實施以來，在國際上卓有聲譽，不但已有50餘國代表前來參訪，同時還有許多國家派駐學員抵台密集學習。2008年諾貝爾經濟學獎得主Paul Krugman更提到，全民健保為人稱道的成效主要有三：全民皆納保、資源耗用少、民眾健康好。

    　不過，為控制費用，中央健康保險局於1998年起陸續於牙科、中醫、西醫基層，2002年7月時進一步於醫院部門，實施具強力規範性的總額預算制。此種作法是將全民健保財務控制責任，完全由中央健康保險局轉移至醫療院所，以致總額實施數年後，醫院、診所開始降低醫師薪水，減少其他醫療人力及住院病床，並以嚴格管控藥品，特別是原廠藥藥品因應。

    　中央健康保險局為了節省費用，不將新藥納入給付，或持續調降新藥及新科技支付單價的做法，不但降低科技研發誘因，也因市場萎縮，導致相關產業失去了資金動能。

    　中研院提到，生技產 業是21世紀經濟發展火車頭，而在這全世界年產值超過8,000億美元市場，台灣的占率僅有0.5％，我們若能善用已有的研發人力及保險優勢，應可吸引更 多國外相關產業來台，不但能形成聚落，更能增加研發能量。但實際情況卻是，政府視全民健保僅為保險，且以保險的財務平衡為最高經營原則，完全忽略了更高層 次、更具潛力的生物科技與新藥產業的發展。