近來屢接獲信託的受託人詢問，信託的受益人向其申請選定核實課稅後或未申請選定時，應如何辦理？
受託人除應按受益人選定的證券交易所得額課稅方式，向該信託開立的證券戶所屬證券商辦理選定外，另應於辦理所得稅法第92條之1規定之信託所得申報時，將受益人選定的證券交易所得額課稅方式併同通報該管稽徵機關。如受益人未向受託人申請選定，則視為選定設算課稅方式。
受託人因受益人有2人以上且其選定的課稅方式不一致，或有其他正當事由，無法向該信託開立的證券戶所屬證券商選定課稅方式時，扣繳義務人應先依所得稅法第88條第3項規定辦理扣繳，再由受託人依同法第3條之4、第89條之1規定計算實際所得額及已扣繳稅款，並依同法第92條之1規定填發扣繳憑單(信託證券戶選定設算課稅者)或免扣繳憑單（信託證券戶選定核實課稅者）予受益人，俾利受益人依其選定證券交易所得額課稅方式課徵所得稅。
各地區國稅局均已設置個人證交所得課稅諮詢窗口，提供專人專線諮詢服務，另於網站建置證交所得課稅專區，提供相關法令、書表及疑義解答，受託人如有不盡明瞭之處，可多加利用。