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營利事業若年度中由查定課徵營業稅改為使用統一發票，其營利事業所得稅應將免用發票期間之查定營業額一併申報，若漏未申報該部分所得者，應予補稅免罰。

漏報查定營業額部分之所得計算，應視其為擴大書審申報或查帳案件有所不同，茲說明如下：
一、營利事業若為擴大書審申報案者，依擴大書面審核要點第5點規定，該查定之營業收入應依擴大書面審核適用純益率核課所得，即（查定之營業收入＋開立發票之金額＋非營業收入）×擴大書面審核適用純益率。
二、營利事業若採查帳申報者，因查定課稅期間之收入成本損費均未申報，應依所得稅法第79條規定，按同業利潤標準核定該期間之所得額（查定之營業收入×同業利潤標準純益率），而本期之課稅所得額即查定營業額核定之所得額加計開立發票期間經稽徵機關查帳核定之所得額。

，營利事業若有年度中改為使用統一發票情事者，應依前揭規定辦理結算申報或申請更正，以正確計算稅務申報之損益及應繳納稅捐。