1590年，美國。北卡羅萊納州的羅阿諾克島上的117位居民突然消失，只留下謎樣的文字『Croatan』….。
1872年，大西洋。漂流在大西洋上的“馬利－西里斯得號”被發現時全部組員如人間蒸發般全數消失。船長的航海日誌上最後僅記載著『12月4日，我的妻子瑪莉…』

1976年，日本。夜美島
狂風之夜，被染成紅色的海，謎樣的警報聲響起，島上的居民突然全部消失。僅尋獲一個失魂男子（阿部寬），不斷如發狂般重複著『警報聲響起時，千萬不要外出』這句令人費解的話語。

沒有任何一個線索可以解開這個謎題，整個事件都將埋葬在黑暗中了……
謎一般的事件隨著時間漸漸淡去……

當此一無解的詭異事件的舞台~夜美島，開始有新的居民遷入，似乎又回到平靜的生活了。

事件發生後的29年，天本由貴（市川由衣）和自由作家的父親真一（森本雷歐）為了病弱的弟弟英夫（西山潤）身體療養的緣故，三人一起遷居至夜美島。單親家庭的緣故，由貴必須要一肩擔負起母親照顧家人的責任。

帶領她們到島上新家的是弟弟英夫的主治醫生南田豐（田中直樹）並且帶領由貴一家人認識島上的一切。但是由貴對於島上居民奇怪的眼神有著非常不舒服的感覺。

幫忙由貴處理搬家事宜的鄰家女孩里美給了由貴一些在島上生活的忠告－『晚上盡量少出門』、『不要太靠近森林的鐵塔』等等，但是讓由貴感到最在意最不舒服的一句話是：當警報聲響起時，千萬不要外出……

奇怪的遭遇、神秘的異教、廢墟中奇怪的文字、讓人毛骨悚然的島歌、人影突然消失的街道、穿紅衣的神祕少女….。然後第一次的警報聲響起，在警報響起聲中外出的父親，漸漸變得越來越怪異。

「報聲到底是甚麼？到底是在哪個地方響起的？」由貴迫切的想從南田醫生那邊得到答案。然後由貴在廢墟中發現了29年前全島島民消失時所殘留的手記。
手記裡記載著夜美島被封印的禁忌歷史～讓人無法理解驚愕的事實，絕對無法解開的謎。裡面記載的是由貴怎麼也無法明白的事件。

在這麼多怪異事件中，由貴看到全島居民消失當日唯一倖存男子（阿部寬）的最後一篇手記寫著：警報第三次響起時，島民開始有了變化……

此時，令人毛骨悚然的死魂曲又在島中央的鐵塔迴盪響起……