水仙尊王原先奉祀於桂林路、西昌街口的水仙宮。1908年市區改正，寺廟被折除，才被遷入艋舺龍山寺，安奉於後殿左龕中。水仙尊王就是大禹或是伍子胥、屈原、李白、王勃，都是歷史上與水有關的名人，民間以水神視之。在此以大禹為主神，其它四位神祗為副祀。航海的人特別信仰，早期移民渡海來台或進行海上貿易，都仰賴水仙尊王的護佑，立廟祭祀十分普遍，後來地位才漸漸被媽祖所取代。這尊神像就是由以前從事海運貿易的艋舺郊商所奉立的。

大禹是古代帝王，因治水有功而受後人所愛戴；伍子胥是楚國人謀國忠誠，卻遭人陷害，最後自刎浮屍於江中；屈原是戰國時代人，因受奸臣所害被貶長沙，徒有憂國之心卻有志難伸，最後投汨羅江自盡；才華洋溢的王勃，天嫉英才二十八歲就溺死於南海；李白是眾所公認的天才詩人，卻因撈水中之月而溺死。這五位神祗都與水有關，故為水利航海安全的神祗而被崇拜。據民間傳說，早年往來兩岸之間的商船若在海上遭遇風暴時，只要船員披頭散髮，每人手挾７支筷子做出划船的動作，口中學征鼓鳴叫，心中祈求水仙尊王的保佑，自會化險為夷。這種風俗稱為「划水仙」。